微山造船業始于上世紀70年代，由起初的木船、水泥船制造，轉換提升制造千噸級鋼質駁船。現有造船企業已擁有山東航宇造舶修造公司、微山縣塘湖造船廠、微山縣新鑫港造船廠等造船企業56家，主要建造鋼質拖輪、1000噸以上鋼質貨船，含配套企業從業人員達20000余人 （含配套企業），2009年實現營業收入25.1億元，年造船2136艘。另有多家航運公司和一個船用風力發電設備研發中心。
    多年來，微山的船舶制造業為國內交通運輸業，工業產品交流，煤炭、建材外運，解決勞動就業，促進地方經濟發展等諸多方面作出了突出重要貢獻。然而，在科學發展跨越發展和轉變經濟發展方式的要求面前，包括甚至與江浙等沿江、沿海省份相比，仍存在基礎建設薄弱，設備、手段落后，缺少專業用船、豪華客船、游艇建造船用配件不全，高科技、高附加值船舶的設計與開發能力不足，以及企業規模相對較小，低、小、散狀況突出，競爭力弱等現實問題。對此，微山以科學發展觀為指導，順應國際國內船舶工業發展趨勢，依托自身區位和資源優勢，以科技進步和機制創新為動力，以提高船舶工業市場競爭力為核心，努力開拓國際國內兩個市場，修造并舉，以造為主，以修為輔，加強配套，培育特色，實施了以市場為導向，堅持貨船、游船、專業船舶并舉的協調發展原則。目標是到2015年實現產值68億元，利稅過6億元。船舶工業基本形成結構優化、組織高效、技術先進、布局合理的產業結構；發展一批現代化的骨干船舶制造企業，培植2至3個名牌產品，形成技術優勢、品牌優勢和市場優勢；完善船舶制造業相關配套的船用配件工業，把微山建成我國中東部地區主要的現代化內河船舶制造基地。年造船能力達到800萬載重噸，年造游船500艘，專業船350艘。一個時期以來，通過整合資源，以微山航宇船舶修造有限公司等6大骨干企業為龍頭，鼓勵民營企業新上船用動力系統、鋼材運輸及預處理等配套產業；引導企業開發、建造高性能內河貨運船、拖船和新型旅游船。目前，全縣已有船舶修造企業40余家，去年建造千噸級以上船舶1432艘，產值達7.5億元。船舶制造產業入選山東省十大產業集群。造船業帶動了運輸業的發展，由13艘鋼船組成的一個運煤拖隊就可拉煤炭萬余噸，比兩列火車拉得還多，成為行駛在京杭運河上的“水上列車”。目前，微山縣沿湖煤炭運輸碼頭達82處，各類船舶8600余艘，航運業年營運收入達12億元。